Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClmpQ8R373 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClmpQ8R373 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClmpQ8R373 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClmpQ8R373 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClmpQ8R373 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClmpQ8R373 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClmpQ8R373 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClmpQ8R373 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClmpQ8R373 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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