Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hecw1Q8K4P8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms