Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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