Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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