Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ccdc113Q8C5T8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccdc113Q8C5T8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccdc113Q8C5T8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccdc113Q8C5T8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccdc113Q8C5T8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ccdc113Q8C5T8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ccdc113Q8C5T8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms