Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4aQ8BW72 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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