Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp38Q8BW70 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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