Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms