Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rhbdd3Q8BP97 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rhbdd3Q8BP97 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rhbdd3Q8BP97 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rhbdd3Q8BP97 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rhbdd3Q8BP97 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd3Q8BP97 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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