Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cyp4f39Q8BGU0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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