Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-M10.4Q85ZW8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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H2-M10.4Q85ZW8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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