Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms