Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms