Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ube2q1Q7TSS2 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ube2q1Q7TSS2 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ube2q1Q7TSS2 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ube2q1Q7TSS2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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