Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo2Q7TPD3 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms