Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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