Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms