Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec31aQ3UPL0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms