Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Puf60Q3UEB3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms