Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gse1Q3U3C9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gse1Q3U3C9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gse1Q3U3C9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gse1Q3U3C9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gse1Q3U3C9 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gse1Q3U3C9 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gse1Q3U3C9 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gse1Q3U3C9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms