Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Brip1os-202ENSMUST00000143819 2604 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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