Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms