Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms