Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec23aQ01405 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms