Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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SeleQ00690 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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SeleQ00690 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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SeleQ00690 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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SeleQ00690 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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SeleQ00690 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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SeleQ00690 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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SeleQ00690 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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SeleQ00690 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SeleQ00690 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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