Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms