Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrn1P97789 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Xrn1P97789 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Xrn1P97789 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Xrn1P97789 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Xrn1P97789 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Xrn1P97789 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Xrn1P97789 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Xrn1P97789 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrn1P97789 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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