Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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