Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tp53bp1P70399 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tp53bp1P70399 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tp53bp1P70399 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tp53bp1P70399 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tp53bp1P70399 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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