Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NfixP70257 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NfixP70257 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NfixP70257 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfixP70257 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfixP70257 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfixP70257 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfixP70257 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfixP70257 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfixP70257 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfixP70257 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NfixP70257 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfixP70257 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NfixP70257 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NfixP70257 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NfixP70257 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NfixP70257 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfixP70257 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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