Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbdsP70122 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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