Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fgd1P52734 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms