Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TspoP50637 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TspoP50637 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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TspoP50637 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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TspoP50637 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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