Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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