Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms