Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbP41155 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbP41155 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbP41155 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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LtbP41155 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LtbP41155 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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