Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd28P31041 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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