Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Defa5P28312 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Defa5P28312 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms