Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms