Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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