Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl9P18340 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms