Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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