Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp4O70480 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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