Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sec22bO08547 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sec22bO08547 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sec22bO08547 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Sec22bO08547 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sec22bO08547 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Sec22bO08547 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
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