Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms