Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms