Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34aG3UW52 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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