Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms