Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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