Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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